CIW - Folge 155 - 15.10.2025 - Apptainer

Wir begrüssen alle Hörerinnen und Hörer zur Folge 155 von "Captain it's Wednesday", dem Podcast über Freie Software und Freie Gesellschaft von GNU/Linux.ch, aufgenommen am 11. Oktober von Götz und Ralf Hersel. In dieser Folge sprechen wir über ein sicheres, portables und benutzerfreundliches Containersystem.

Was ist Apptainer: Paketiere Software auf deinem Laptop, rechne auf dem HPC Cluster und publiziere den Code für Reproduzierbarkeit https://www.nature.com/articles/533452a in einer Datei.
Aus der Dokumentation:
Verifizierbare Reproduzierbarkeit
Verifizierbare Signatur
Verschlüsseltes Publizieren
Integration (Zugriff auf Netzwerk, Dateisystem, Beschleuniger) über Isolation
Alles in einer unveränderlichen Datei
Einfache Sicherheitsmodell: Im Container bist du der gleiche Nutzer*in wie auf dem Host
Bauen eines Containers:
Mit einem Definition-File (.def) auf Basis verschiedener Quellen (Docker, Apptainer, ...) eigenen Apptainer bauen.
Erzeuge ein Verzeichnis und passe es in der Shell an.
Erzeuge weitere Images die das ursprüngliche Image alternieren.
Verwenden des Containers:
- Shell
- Script
- Services
Erweiterbar durch Plugins.
Unterstützt MPI (Message Passing Interface) über verschiedene Compute-Nodes
Richtlinien über Netzwerk, eingebundene Verzeichnisse und Rechenressourcen sind einfach zu übergeben.
Checkpointing: Speichere einen Apptainer während dieser läuft und starte diesen in dem Zustand später neu.

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Einsatzszenarien im HPC